Coverage for biobb_dna/utils/constants.py: 100%

1 

2hp_singlebases = [ 

3 "shear", 

4 "stagger", 

5 "stretch", 

6 "buckle", 

7 "opening", 

8 "propel", 

9 "inclin", 

10 "tip", 

11 "xdisp", 

12 "ydisp" 

13] 

14 

15hp_basepairs = [ 

16 "majw", 

17 "majd", 

18 "minw", 

19 "mind", 

20 "rise", 

21 "shift", 

22 "slide", 

23 "roll", 

24 "tilt", 

25 "twist" 

26] 

27 

28hp_angular = [ 

29 "roll", 

30 "tilt", 

31 "twist", 

32 "buckle", 

33 "opening", 

34 "propel", 

35 "inclin", 

36 "tip" 

37] 

38 

39hp_translational = [ 

40 "shear", 

41 "stagger", 

42 "stretch", 

43 "xdisp", 

44 "ydisp", 

45 "majw", 

46 "majd", 

47 "minw", 

48 "mind", 

49 "rise", 

50 "shift", 

51 "slide" 

52] 

53 

54hp_backbone = [ 

55 "alphaC", 

56 "alphaW", 

57 "betaC", 

58 "betaW", 

59 "gammaC", 

60 "gammaW", 

61 "deltaC", 

62 "deltaW", 

63 "chiC", 

64 "chiW", 

65 "phaseC", 

66 "phaseW", 

67 "epsilC", 

68 "epsilW", 

69 "zetaC", 

70 "zetaW" 

71] 

72 

73helical_parameters = hp_basepairs + hp_singlebases + hp_backbone