Coverage for biobb_analysis/test/unitests/test_ambertools/test_cpptraj_rms.py: 100%

1from biobb_common.tools import test_fixtures as fx 

2from biobb_analysis.ambertools.cpptraj_rms import cpptraj_rms 

3 

4 

5class TestCpptrajRmsFirst(): 

6 def setup_class(self): 

7 fx.test_setup(self, 'cpptraj_rms_first') 

8 

9 def teardown_class(self): 

10 fx.test_teardown(self) 

11 pass 

12 

13 def test_rms_first(self): 

14 cpptraj_rms(properties=self.properties, **self.paths) 

15 assert fx.not_empty(self.paths['output_cpptraj_path']) 

16 assert fx.equal(self.paths['output_cpptraj_path'], self.paths['ref_output_cpptraj_path']) 

17 assert fx.not_empty(self.paths['output_traj_path']) 

18 assert fx.equal(self.paths['output_traj_path'], self.paths['ref_output_traj_path']) 

19 

20 

21class TestCpptrajRmsAverage(): 

22 def setup_class(self): 

23 fx.test_setup(self, 'cpptraj_rms_average') 

24 

25 def teardown_class(self): 

26 fx.test_teardown(self) 

27 pass 

28 

29 def test_rms_average(self): 

30 cpptraj_rms(properties=self.properties, **self.paths) 

31 assert fx.not_empty(self.paths['output_cpptraj_path']) 

32 assert fx.equal(self.paths['output_cpptraj_path'], self.paths['ref_output_cpptraj_path']) 

33 assert fx.not_empty(self.paths['output_traj_path']) 

34 assert fx.equal(self.paths['output_traj_path'], self.paths['ref_output_traj_path']) 

35 

36 

37class TestCpptrajRmsExperimental(): 

38 def setup_class(self): 

39 fx.test_setup(self, 'cpptraj_rms_experimental') 

40 

41 def teardown_class(self): 

42 fx.test_teardown(self) 

43 pass 

44 

45 def test_rms_experimental(self): 

46 cpptraj_rms(properties=self.properties, **self.paths) 

47 assert fx.not_empty(self.paths['output_cpptraj_path']) 

48 assert fx.equal(self.paths['output_cpptraj_path'], self.paths['ref_output_cpptraj_path']) 

49 assert fx.not_empty(self.paths['output_traj_path']) 

50 assert fx.equal(self.paths['output_traj_path'], self.paths['ref_output_traj_path'])