Coverage for biobb_analysis/test/unitests/test_ambertools/test_cpptraj_rmsf.py: 100%

1# type: ignore 

2from biobb_common.tools import test_fixtures as fx 

3from biobb_analysis.ambertools.cpptraj_rmsf import cpptraj_rmsf 

4 

5 

6class TestCpptrajRmsfFirst(): 

7 def setup_class(self): 

8 fx.test_setup(self, 'cpptraj_rmsf_first') 

9 

10 def teardown_class(self): 

11 fx.test_teardown(self) 

12 pass 

13 

14 def test_rmsf_first(self): 

15 cpptraj_rmsf(properties=self.properties, **self.paths) 

16 assert fx.not_empty(self.paths['output_cpptraj_path']) 

17 assert fx.equal(self.paths['output_cpptraj_path'], self.paths['ref_output_cpptraj_path']) 

18 

19 

20class TestCpptrajRmsfAverage(): 

21 def setup_class(self): 

22 fx.test_setup(self, 'cpptraj_rmsf_average') 

23 

24 def teardown_class(self): 

25 fx.test_teardown(self) 

26 pass 

27 

28 def test_rmsf_average(self): 

29 cpptraj_rmsf(properties=self.properties, **self.paths) 

30 assert fx.not_empty(self.paths['output_cpptraj_path']) 

31 assert fx.equal(self.paths['output_cpptraj_path'], self.paths['ref_output_cpptraj_path']) 

32 

33 

34class TestCpptrajRmsfExperimental(): 

35 def setup_class(self): 

36 fx.test_setup(self, 'cpptraj_rmsf_experimental') 

37 

38 def teardown_class(self): 

39 fx.test_teardown(self) 

40 pass 

41 

42 def test_rmsf_experimental(self): 

43 cpptraj_rmsf(properties=self.properties, **self.paths) 

44 assert fx.not_empty(self.paths['output_cpptraj_path']) 

45 assert fx.equal(self.paths['output_cpptraj_path'], self.paths['ref_output_cpptraj_path'])