Coverage for biobb_cmip/test/unitests/test_cmip/test_cmip_run.py: 100%

1# type: ignore 

2from biobb_common.tools import test_fixtures as fx 

3from biobb_cmip.cmip.cmip_run import cmip_run 

4 

5 

6# class TestCmipMip(): 

7# def setup_class(self): 

8# fx.test_setup(self, 'cmip_mip') 

9# 

10# def teardown_class(self): 

11# #pass 

12# fx.test_teardown(self) 

13# 

14# def test_cmip_mip(self): 

15# cmip(properties=self.properties, **self.paths) 

16# assert fx.not_empty(self.paths['output_cube_path']) 

17# assert fx.not_empty(self.paths['output_grd_path']) 

18# assert fx.equal(self.paths['output_grd_path'], self.paths['ref_output_cmip_mip_grd_path']) 

19# assert fx.equal(self.paths['output_cube_path'], self.paths['ref_output_cmip_mip_cube_path']) 

20 

21 

22# class TestCmipDocking(): 

23 

24# def setup_class(self): 

25# fx.test_setup(self, 'cmip_docking') 

26# 

27# def teardown_class(self): 

28# #pass 

29# fx.test_teardown(self) 

30# 

31# def test_cmip_docking(self): 

32# cmip(properties=self.properties, **self.paths) 

33# assert fx.not_empty(self.paths['output_pdb_path']) 

34# assert fx.not_empty(self.paths['output_grd_path']) 

35# assert fx.not_empty(self.paths['output_rst_path']) 

36# assert fx.equal(self.paths['output_pdb_path'], self.paths['ref_output_cmip_docking_pdb_path'], remove_hetatm=False) 

37# #assert fx.equal(self.paths['output_grd_path'], self.paths['ref_output_cmip_docking_grd_path']) 

38# #assert fx.equal(self.paths['output_rst_path'], self.paths['ref_output_cmip_docking_rst_path']) 

39 

40 

41class TestCmipRunEnergy(): 

42 def setup_class(self): 

43 fx.test_setup(self, 'cmip_run') 

44 

45 def teardown_class(self): 

46 # pass 

47 fx.test_teardown(self) 

48 

49 def test_cmip_run_energy(self): 

50 cmip_run(properties=self.properties, **self.paths) 

51 assert fx.not_empty(self.paths['output_byat_path']) 

52 # assert fx.equal(self.paths['output_byat_path'], self.paths['ref_output_byat_path']) 

53 

54# class TestCmipSolvation(): 

55 

56# def setup_class(self): 

57# fx.test_setup(self, 'cmip_solvation') 

58# 

59# def teardown_class(self): 

60# #pass 

61# fx.test_teardown(self) 

62# 

63# def test_cmip_mip(self): 

64# cmip(properties=self.properties, **self.paths) 

65# assert fx.not_empty(self.paths['output_cube_path']) 

66# assert fx.not_empty(self.paths['output_grd_path']) 

67# assert fx.equal(self.paths['output_grd_path'], self.paths['ref_output_cmip_mip_grd_path']) 

68# assert fx.equal(self.paths['output_cube_path'], self.paths['ref_output_cmip_mip_cube_path'])